Estrategia de diagnóstico

La estrategia de diagnóstico de Latin-SEQ usa un algoritmo guiado por la sospecha clínica de cada paciente y determinada por el centro de referencia. Así, los pacientes con enfermedades neuromusculares (ENM) hereditarias serán evaluados mediante cribado genético específico utilizando el test de Multiple Ligation Probe Amplification (MLPA) para descartar condiciones como la Atrofia Muscular Espinal (AME), Distrofia muscular de Duchenne/Becker, y las neuropatías tipo Charcot Marie Tooth o el secuenciamiento de mutaciones recurrentes asociadas a los síndromes miasténicos congénitos y las miopatías mitocondriales. Se prevé que este cribado inicial logrará diagnosticar el 20% de los casos, approx. Aquellos casos que no sean diagnosticados mediante este método se someterán a secuenciación del exoma completo.

En una primera etapa, se analizarán los exomas focalizándose en un panel de más de 600 genes relacionados con enfermedades neuromusculares (basado en http://www.musclegenetable.fr/) y que se irá actualizando cada 6 meses, con el que se espera poder resolver el 40-60% de los casos. Para los casos no resueltos, se realizará un análisis más exhaustivo del exoma completo, incluyendo la secuenciación de familiares cuando sea posible. Este enfoque permitirá no solo el diagnóstico de enfermedades inusuales, sino también la identificación de genes nuevos.  En estos casos, se realizarán estudios para validar la patogenicidad de variantes identificadas y confirmar su relevancia mediante diversos criterios, incluyendo análisis in sillico y estudios funcionales en modelos celulares o animales.

En el Latin-SEQ, la interpretación y análisis de los resultados genéticos siguen un proceso meticuloso y riguroso: los datos obtenidos se analizan de manera reiterativa y los resultados preliminares se comparten con los médicos remitentes. Estos resultados se discuten en reuniones periódicas para evaluar los hallazgos identificados en función de la presentación clínica del paciente y familiares. Para aquellos casos que se consideren resueltos, se emitirá un informe genético final. Para los casos más complejos, se llevarán a cabo reuniones multidisciplinarias donde los resultados genéticos se discutirán en el marco de otros estudios disponibles como resonancia magnética o biopsia muscular.

Informes genéticos

Los informes genéticos* emitidos por el equipo de coordinación, proveerán información sobre las variantes genéticas identificadas y su clasificación as siguiendo las reglas sugeridas de la ACMG (American College of Medical Genetics and Genomics) detallando cada uno de los parámetros incluidos, así como las publicaciones relevantes.

En los informes genéticos se proporcionará a los médicos referentes el contacto de los REGISTROS/ASOCIACIONES DE PACIENTES disponibles, preferentemente en el país de origen o a nivel internacional, para que los compartan con los pacientes y sus familias según sus protocolos.

Desafortunadamente, la gran mayoría de las ENM no tienen cura ni tratamiento; si lo hubiera esta información también será incluida en los informes genéticos. El seguimiento clínico de los pacientes está a cargo de los médicos referentes.

*Es importante destacar que los resultados presentados en estos informes son obtenidos como parte de un estudio de investigación y, por lo tanto, no constituyen una acreditación diagnóstica. La interpretación y aplicación de estos datos es responsabilidad exclusiva de los médicos referentes. El equipo de Latin-SEQ no se responsabiliza del uso que se le dé a la información contenida en estos informes.

*Nótese que el análisis y la interpretación proporcionada en este informe depende de la correcta identificación de las muestras y la precisión de los detalles clínicos.Nótese que el análisis y la interpretación proporcionada en este informe depende de la correcta identificación de las muestras y la precisión de los detalles clínicos.

Interpretación de los Informes Genéticos
POSITIVO:
Variante/s LP/P en gen compatible con el fenotipo
a) Heterocigota en gen AD
b) Homocigota o heterocigota "compuesto" en gen AR
COMPATIBLE:
a) Variante/s de significado incierto, en gen altamente compatible con el fenotipo
b) Una variante heterocigota LP/P en gen AR
NO CONCLUYENTE:
Variante/s de significado incierto
(*) Puede modificarse en el futuro
INCOMPATIBLE:
Variante LP/P en gen no compatible con el fenotipo del paciente
NEGATIVO:
Ninguna variante significativa
(*) Limitaciones del estudio
(**) Puede modificarse en el futuro

LP/P: Likely Pathogenic/Pathogenic; AR: Autosomal Recessive; AD: Autosomal Dominant

Metodología Mutaciones Recurrentes

Metodología WES

  • 1

    Método de Ensayo: Secuenciación del Exoma Completo (WES), kit de captura KAPA HyperExome (Roche), Illumina NovaSeq 6000.

  • 2

    Pipeline Bioinformático: Mapeo de lecturas e identificación de variantes SNV/indel y CNV/SV: DRAGEN v4.4.6. Los archivos VCF resultantes son anotados con las herramientas: VEP, SnpEff, SnpSift, e InterVar para SNV/indels, y AnnotSV para CNV/SV.

  • 3

    Análisis de Datos: los archivos VCF son cargados en la Plataforma de Análisis Genoma-Fenoma (GPAP, RD-Connect) (https://platform.rd-connect.eu/#/), donde se aplican distintos criterios de filtrado para la identificación de posibles variantes causantes.

    En la ronda de análisis principal se aplican criterios estándar, habitualmente utilizados en el análisis genético de enfermedades raras: Frecuencia del Alelo Menor (MAF) <1% en la población control (gnomAD v4.0) y Predictor del Efecto de Variante (VEP) moderado y alto (es decir, variantes no sinónimas e indels que mantienen el marco de lectura, y variantes truncantes: sin sentido, de splicing e indels que afecten el marco de lectura) para los distintos modos de herencia: recesiva, dominante y ligada al X. Se analizan variantes de un solo nucleótido (SNVs), inserciones y deleciones pequeñas (indels) y variantes de número de copia (CNV), en las regiones codificantes del panel in silico aplicado.

    En esta instancia se utiliza el panel de análisis primario, que contiene 891 genes asociados con ENM. La lista completa de genes se detalla en LISTA PRIMARIA DE GENES.

    En los casos en que este primer análisis no permita identificar variantes relevantes, se podrá proceder a una segunda ronda de análisis, guiada por el fenotipo del paciente. En esta fase, se aplicarán paneles genéticos expandidos en función de la sospecha clínica inicial y lo discutido en las reuniones multidisciplinares con el centro de referencia. En este análisis también se incluirán variantes de menor impacto, como por ejemplo variantes sinónimas e intrónicas. Los detalles del análisis secundario de cada paciente pueden ser solicitados.

Metodología de Segregación

  • 1

    Método de Ensayo: Amplificación por PCR y secuenciación de Sanger de las variantes de interés identificadas en el caso índice, utilizando primers específicos para cada región genómica analizada.

  • 2

    Análisis de Segregación: Las variantes se analizan en muestras de ADN de los familiares disponibles, tanto afectados como no afectados, con el objetivo de determinar su patrón de herencia y evaluar su cosegregación con el fenotipo observado en la familia. Este análisis también permite establecer la fase de variantes heterocigotas compuestas, es decir, determinar si se encuentran en alelos diferentes, en trans, o en el mismo alelo, en cis. La clasificación de una variante como de novo presupone que la filiación biológica indicada es correcta, salvo que esta haya sido confirmada mediante otros estudios específicos.

Los resultados se interpretan juntamente con los antecedentes familiares, el modo de herencia esperado y la información clínica disponible. La información sobre los primers utilizados y las condiciones técnicas del ensayo puede ser solicitada.

Clasificación ACMG

Las variantes genómicas identificadas son clasificadas siguiendo las recomendaciones y los criterios de patogenicidad originales del American College of Medical Genetics (ACMG, Richards et al. 2015) (Criterios de patogenicidad) mediante las herramientas de acceso libre InterVar (https://wintervar.wglab.org/), Varsome (https://sso.varsome.com) y Franklin (https://franklin.genoox.com). Información adicional genética y clínica es curada manualmente. Se detalla además si la variante identificada ha sido previamente reportada, ya sea en la literatura o en base de datos clínicas (ClinVar y LOVD, https://www.lovd.nl/). Nótese que esta información y la clasificación resultante puede estar sujeta a cambios (LIMITACIONES).

Criterios de evidencia de patogenicidad

  • Pathogenic Very Strong:

    • PVS1: Se aplica a variantes de tipo truncamiento de proteína (incluyendo variantes sin sentido, cambio de marco de lectura o de splicing) en genes donde la pérdida de función es un mecanismo de enfermedad.

  • Pathogenic Strong (PS):

    • PS1: Mismo cambio de aminoácido que una variante patogénica previamente establecida, pero a través de un cambio de nucleótido diferente.
    • PS2: De novo (confirmado) en el paciente con confirmación tanto de la maternidad como de la paternidad.
    • PS3: Estudios funcionales muestran un efecto perjudicial coherente con el mecanismo de la enfermedad.
    • PS4: Variante significativamente más frecuente en personas enfermas que en personas sanas (controles)

  • Pathogenic Moderate (PM):

    • PM1: Variante ubicada en una región funcionalmente relevante o un hot spot.
    • PM2: Ausente o en muy baja frecuencia en la población control (gnomAD, etc.).
    • PM3: En enfermedades recesivas, detectada en trans con otra variante patogénica.
    • PM4: Variante que cambia el tamaño de la proteína (indel en el marco de lectura o perdida del codon stop) en un gen donde este mecanismo es causante de enfermedad.
    • PM5: Nueva variante de cambio de aminoácido en un residuo donde ya se conoce otra alteración patogénica.
    • PM6: Asumida de novo (sin confirmación parental).

  • Pathogenic Supporting (PP):

    • PP1: Cosegregación con la enfermedad en múltiples familiares afectados.
    • PP2: Variante de cambio de aminoácido en un gen con poca tolerancia a este tipo de variantes y donde son causa de la enfermedad.
    • PP3: Múltiples métodos computacionales predicen efecto deletéreo (e.g., REVEL, CADD).
    • PP4: La presentación y la historia clínica del paciente son altamente específicos de la enfermedad.
    • PP5: Reportada previamente en una fuente confiable (obsoleta según ClinGen; usar con cautela)

Limitaciones

La evaluación interna de la especificidad y sensibilidad de los protocolos de detección de variantes utilizando el kit de captura KAPA HyperExome de Roche® es del 99.54% y 99.69%, respectivamente, para variantes de un solo nucleótido, y del 70.62% y 89.99% para pequeñas inserciones/deleciones (indels) de hasta 10 nucleótidos. Otros tipos de variantes genéticas como expansiones de repeticiones, variantes en número de copias, variantes estructurales o variaciones en regiones de alta homología (pseudogenes y homólogos) podrían no ser detectadas. Este análisis tampoco captura variantes intrónicas profundas, regiones intergénicas, ni variantes en regiones promotoras o reguladoras del gen.

Las variantes consecutivas que forman haplotipos no se agrupan en variantes de múltiples nucleótidos (MNVs) y se informan como eventos individuales.

Las variantes de significado incierto (VUS) en genes aparentemente no compatibles con la presentación clínica disponible del paciente no se incluyen en los informes genéticos, pero pueden ser proporcionadas a solicitud.

Las variantes identificadas durante el análisis de exoma no se validan sistemáticamente mediante un método independiente. Cuando se realiza una validación o un estudio adicional, este se especifica en el informe correspondiente.

A menos que se realicen estudios parentales de segregación, la heterocigosis compuesta y la herencia biparental de las variantes homocigotas, no están confirmadas, sino solo asumidas.

En los estudios de segregación adicionales, mediante secuenciación de Sanger, la clasificación de una variante como de novo presupone que la filiación biológica indicada es correcta, salvo que esta haya sido confirmada mediante otros estudios específicos.

A menos que se especifique lo contrario, los datos genómicos de cada paciente son analizados para un panel in silico de 891 genes asociados a enfermedades neuromusculares. La lista completa de genes incluidos en este panel primario se detalla en LISTA PRIMARIA DE GENES.

Las variantes genómicas se clasifican de acuerdo con las recomendaciones originales del American College of Medical Genetics (ACMG) (Richards et al. 2015). Tanto la clasificación de las variantes como la interpretación de su relevancia diagnóstica se basan en el conocimiento científico y clínico disponible en el momento del análisis y, por lo tanto, están sujetas a cambios a medida que surja nueva información relevante.

LISTA PRIMARIA DE GENES

Este panel primario se ha creado en base a la versión más reciente de la Tabla de Genes Neuromusculares (https://www.worldmusclesociety.org/page/gene-table) (Benarroch et al., 2025, https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41448968/) y se ha complementado con información procedente de fuentes públicas y datos internos aún no publicados.

Esta lista es revisada aproximadamente cada 6 meses.
Versión actual (Julio 2026), n=891:

AARS1, AARS2, ABCC9, ABCD3, ABHD16A, ABHD5, ABRA, ACAD9, ACADVL, ACTA1, ACTC1, ACTN2, ACTN3, ACVR1, ADAMTS15, ADCY6, ADGRG6, ADPRS, ADSS1, AFG3L2, AGL, AGRN, AHCY, AHNAK2, AIFM1, AKAP9, ALDH18A1, ALDH3A1, ALDH3A2, ALDOA, ALG14, ALG2, ALPK3, ALS2, AMFR, AMPD1, AMPD2, ANG, ANK2, ANKRD1, ANKRD2, ANKRD23, ANO10, ANO5, ANXA1, ANXA11, AP4B1, AP4E1, AP4M1, AP4S1, AP5Z1, APOBEC2, APOO, APTX, AR, ARHGAP19, ARHGEF10, ARL6IP1, ART1, ASAH1, ASB12, ASB2, ASB5, ASCC1, ASCC3, ATAD3A, ATG5, ATG7, ATL1, ATL3, ATM, ATP13A2, ATP1A1, ATP1A2, ATP1B4, ATP2A1, ATP2A2, ATP5F1B, ATP7A, ATXN1, ATXN10, ATXN2, ATXN3, ATXN7, ATXN8, ATXN8OS, B3GALNT2, B4GALNT1, B4GAT1, BAG3, BAG5, BEAN1, BEST3, BET1, BICD2, BIN1, BSCL2, C10orf71, C19orf12, C9orf72, CA3, CA8, CACNA1A, CACNA1C, CACNA1G, CACNA1H, CACNA1S, CACNB2, CACNB4, CACNG1, CACNG6, CADM3, CALM1, CALM2, CALM3, CALR3, CAP2, CAPN1, CAPN3, CAPNS1, CASQ1, CASQ2, CAV3, CAVIN1, CAVIN4, CCDC78, CCDC88C, CCT5, CDC40, CDH2, CELSR1, CFAP276, CFL2, CHAT, CHCHD10, CHD8, CHKB, CHMP2B, CHP1, CHRNA1, CHRNB1, CHRND, CHRNE, CHRNG, CIAO1, CKM, CLCN1, CLN3, CLTCL1, CMYA5, CNBP, CNTN1, CNTNAP1, COA7, COL12A1, COL13A1, COL25A1, COL6A1, COL6A2, COL6A3, COLQ, COQ2, COQ4, COQ5, COQ6, COQ7, COQ8A, COQ9, COX15, COX16, COX18, COX20, COX6A1, COX6A2, CPT1C, CPT2, CRPPA, CRYAB, CSDE1, CSRP3, CTDP1, CTNNA3, CWF19L1, CYP2U1, CYP7B1, DAB1, DAG1, DARS2, DCAF8, DCTN1, DDHD1, DDHD2, DDIT4L, DES, DGAT2, DGUOK, DHTKD1, DMD, DMPK, DNA2, DNAJB2, DNAJB4, DNAJB6, DNM2, DNMT1, DOK7, DOLK, DPAGT1, DPM1, DPM2, DPM3, DSC2, DSG2, DSP, DST, DSTYK, DTNA, DUSP13B, DUSP29, DUX4, DYNC1H1, DYSF, ECEL1, EEF1A2, EEF2, EGF, EGR2, ELOVL4, ELOVL5, ELP1, EMD, EMILIN1, ENDOG, ENO3, ENTPD1, ENTPD5, ERBB3, ERBB4, ERLIN1, ERLIN2, ETFA, ETFB, ETFDH, EXOSC3, EXOSC8, EXOSC9, EYA4, FA2H, FABP3, FAM111B, FARS2, FASTKD2, FAT2, FBLN5, FBP2, FBXL4, FBXO32, FBXO38, FDX2, FEM1A, FGD4, FGF14, FHL1, FHL3, FHOD3, FICD, FIG4, FILIP1, FKRP, FKTN, FLAD1, FLII, FLNA, FLNC, FLVCR1, FOXK2, FTH1, FTL, FUS, FXN, FXR1, GAA, GAN, GAPDH, GARS1, GATAD1, GBA2, GBE1, GBF1, GDAP1, GDAP2, GFER, GFPT1, GGPS1, GIPC1, GJA5, GJB1, GJB3, GJC2, GLDN, GLE1, GLUL, GMPPB, GNB4, GNE, GOLGA2, GOSR2, GPD1L, GRID2, GRM1, GYG1, GYS1, H19, HACD1, HACE1, HARS1, HCN4, HEXB, HINT1, HJV, HK1, HMGCR, HMGCS1, HNRNPA1, HNRNPA2B1, HNRNPDL, HOXD10, HPDL, HRAS, HSP90AB1, HSPB1, HSPB3, HSPB6, HSPB7, HSPB8, HSPD1, HSPG2, IBA57, IDI2, IFRD1, IGFN1, IGHMBP2, ILK, INF2, INPP5K, IP6K3, ISCU, ITGA7, ITPR1, ITPR3, JAG1, JAG2, JPH1, JPH2, JSRP1, JUP, KARS1, KBTBD13, KCNA1, KCNA5, KCNA7, KCNC3, KCND3, KCNE1, KCNE2, KCNE3, KCNH2, KCNJ11, KCNJ12, KCNJ18, KCNJ2, KCNJ5, KCNQ1, KIDINS220, KIF1A, KIF1B, KIF1C, KIF20A, KIF21A, KIF26B, KIF5A, KLC2, KLHL30, KLHL33, KLHL38, KLHL40, KLHL41, KLHL9, KPNA3, KY, L1CAM, LAMA2, LAMA4, LAMA5, LAMB2, LAMC1, LAMP2, LARGE1, LAS1L, LDB3, LDHA, LETM1, LIG3, LIMS2, LINGO4, LITAF, LMNA, LMOD2, LMOD3, LPCAT3, LPIN1, LRIF1, LRP10, LRP12, LRP4, LRRC38, LRSAM1, MACF1, MAFA, MAG, MAMDC2, MAP3K20, MAPT, MARS1, MARS2, MATR3, MB, MCM3AP, MCOLN1, MEGF10, MET, MFN2, MGME1, MIB1, MICU1, MIR1-1HG, MIR133A2, MKNK2, MLIP, MME, MORC2, MPDU1, MPV17, MPZ, MRE11, MRLN, MRPL3, MRPL44, MRPS25, MSTN, MSTO1, MT1X, MT2A, MT-CO1, MT-CO2, MT-CYB, MTHFSD, MTM1, MTMR2, MT-ND1, MTND1P23, MT-ND2, MTND2P28, MT-ND3, MT-ND4, MT-ND5, MT-ND6, MTO1, MTPAP, MTRFR, MT-RNR1, MT-RNR2, MT-TA, MT-TC, MT-TD, MT-TE, MT-TF, MT-TG, MT-TH, MT-TI, MT-TK, MT-TL1, MT-TL2, MT-TM, MT-TN, MT-TP, MT-TQ, MT-TR, MT-TS1, MT-TS2, MT-TT, MT-TV, MT-TW, MT-TY, MUSK, MYADML2, MYBPC1, MYBPC2, MYBPC3, MYBPH, MYF6, MYH1, MYH14, MYH2, MYH3, MYH6, MYH7, MYH8, MYL1, MYL11, MYL12A, MYL2, MYL3, MYL4, MYLK2, MYMK, MYMX, MYO18B, MYO9A, MYO9B, MYOD1, MYOG, MYOM3, MYOT, MYOZ1, MYOZ2, MYOZ3, MYPN, NAA10, NAGLU, NARS1, NBAS, NDRG1, NDUFAF1, NDUFB10, NEB, NEFH, NEFL, NEK1, NEK9, NEXN, NFU1, NGF, NHERF1, NIPA1, NKX6-2, NMNAT2, NOP56, NOTCH2NLC, NPPA, NPTX1, NRAP, NSUN3, NT5C2, NTRK1, NUP155, NUP88, NUTM2B-AS1, OBSCN, OGDHL, OPA1, OPTN, ORAI1, OXA1L, PABPN1, PACSIN3, PAX7, PCNA, PCYT2, PDK3, PDK4, PDLIM3, PDYN, PERM1, PEX7, PFKM, PFN1, PGAM2, PGK1, PGM1, PGPEP1L, PHKA1, PHKG1, PHOX2A, PHYH, PI4KA, PIEZO2, PIGK, PIP5K1C, PITRM1, PITX2, PKP2, PLD3, PLEC, PLEKHG5, PLIN4, PLN, PLP1, PMP2, PMP22, PMPCA, PNKP, PNPLA2, PNPLA6, PNPLA8, PNPT1, POC1A, POC1B, POC5, POGLUT1, POLG, POLG2, POLR3B, POMGNT1, POMGNT2, POMK, POMT1, POMT2, POPDC1, POPDC3, PPCS, PPDPFL, PPP1R27, PPP2R2B, PRDM12, PRDM16, PRDX3, PRECSIT, PREPL, PRKAG2, PRKAG3, PRKCG, PRPH, PRPS1, PRUNE1, PRX, PSAT1, PSEN1, PSEN2, PSMB4, PTPN11, PTRH2, PUM1, PURA, PUS1, PYGM, PYROXD1, RAB7A, RAF1, RAPSN, RBCK1, RBFOX1, RBM20, RBM7, REEP1, REEP2, RETREG1, RFC1, RFC4, RILPL1, RNASEH1, RNASEH1P1, RNF170, RNF216, RNF220, RNU4-2, RPH3A, RPL10, RPL18AP3, RPL19, RPL26, RPL27, RPL3L, RPLP0, RPLP1, RPLP2, RPS11, RPS12, RPS13, RPS16, RPS18, RRM2B, RTN2, RUBCN, RXYLT1, RYR1, RYR2, RYR3, SACS, SAMD9L, SBF1, SBF2, SCN11A, SCN1B, SCN2A, SCN2B, SCN3B, SCN4A, SCN4B, SCN5A, SCN9A, SCO2, SCYL1, SDHA, SELENOI, SELENON, SEPTIN1, SETX, SGCA, SGCB, SGCD, SGCE, SGCG, SGPL1, SH3TC2, SIGMAR1, SIL1, SIX1, SLC12A6, SLC16A1, SLC18A3, SLC1A3, SLC22A5, SLC25A1, SLC25A20, SLC25A26, SLC25A4, SLC25A42, SLC25A46, SLC33A1, SLC36A2, SLC52A2, SLC52A3, SLC5A7, SLC9A1, SLN, SMCHD1, SMN1, SMPD4, SMPX, SMTNL1, SMTNL2, SNAP25, SNTA1, SNUPN, SNX14, SOD1, SOD2, SORD, SOX8, SPART, SPAST, SPEG, SPG11, SPG21, SPG7, SPTAN1, SPTB, SPTBN2, SPTBN4, SPTLC1, SPTLC2, SPTSSA, SQSTM1, SRPK3, STAC3, STIM1, STUB1, SUCLA2, SUCLG1, SURF1, SVIL, SYNE1, SYNE2, SYPL2, SYT14, SYT2, TAFAZZIN, TARDBP, TBCK, TBK1, TBP, TCAP, TDP1, TDP2, TECPR2, TECRL, TEFM, TFG, TGFB3, TGM6, THAP11, THG1L, THOC2, TIA1, TIMM22, TK2, TMEM126B, TMEM168, TMEM233, TMEM240, TMEM38A, TMEM43, TMEM52, TMEM63C, TMEM65, TMOD4, TMPO, TNNC1, TNNC2, TNNI1, TNNI2, TNNI3, TNNT1, TNNT2, TNNT3, TNPO3, TOMM70, TOP3A, TOR1A, TOR1AIP1, TPM1, TPM2, TPM3, TPP1, TPT1, TRAPPC11, TRAPPC2L, TRDN, TRIM2, TRIM32, TRIM54, TRIM63, TRIM72, TRIP4, TRPC3, TRPV4, TSFM, TTBK2, TTN, TTPA, TTR, TUBA4A, TUBB3, TWNK, TXLNB, TXNIP, TYMP, UBA1, UBA5, UBAP1, UBC, UBQLN2, UCHL1, UCP3, UGDH, UNC13A, UNC45B, UNC50, VAMP1, VAPB, VCL, VCP, VEZF1, VGLL2, VHRT, VMA21, VPS13D, VPS37A, VPS41, VRK1, VWA1, VWA3B, WARS1, WASHC5, WDR73, WNK1, WWOX, XIRP2, XPNPEP3, XRCC1, YARS1, YARS2, YBX3, YIPF7, ZBTB42, ZC4H2, ZFHX2, ZFHX3, ZFYVE26, ZFYVE27

Registros/asociaciones de pacientes

En los informes genéticos también se facilitará a los médicos referentes de los pacientes diagnosticados el contacto de los registros de pacientes que haya disponibles preferentemente en el país de origen u otros registros internacionales, quienes serán los responsables de compartirlos con los pacientes y sus familias siguiendo sus propios protocolos.

La participación en los registros es totalmente voluntaria y a libre elección del paciente y su familia. Los registros de pacientes son una herramienta importante que permite el archivado de datos clínicos y genéticos de manera sistemática y que tiene como objetivo principal la localización de pacientes para ensayos clínicos. Los registros además son una red de apoyo para los pacientes con recursos adicionales que pueden ayudar durante todo el proceso de la enfermedad.  Los datos contenidos en los registros son de gran valor y contribuyen al avance de la investigación y el conocimiento sobre enfermedades neuromusculares en la región.

A continuación, proporcionamos un listado de algunos registros y/o asociaciones de pacientes de diversos países que hemos recopilado, y que iremos actualizando. Sin embargo, esta lista no es exhaustiva, por lo que recomendamos investigar más a fondo la existencia de otros registros o asociaciones en su país de residencia.

AME (Atrofia Muscular Espinal): Toda LATAM ALAME: Alianza Latinoamericana AME O contactar a Claudia Sánchez | claudia.sanchez@amelatam.org | +44 7533 768502
Argentina Familias AME Argentina
Brasil INAME
Chile Corporación Familias AME Chile
Colombia Fundación AME Colombia Sara y Sofia «Famecol S&S» O contactar a Claudia Sánchez | registrodepacientes@famecolombia.org | +44 7533 768502
España CuidAME
México CurAME
Uruguay Familias con AME Uruguay
Reino Unido UK SMA Registry
República Dominicana CurAME
Enfermedades de Depósito Lisosomal y Glucogenosis. Pompe y otras: Colombia ACOPEL: Asociación Colombiana de Pacientes con Enfermedades de Depósito Lisosomal
GLUCOLATINO: Comunidad de Glucogenosis Hepática
Distrofia Facioescapulohumeral (FSHD): Brasil ABRAFEUI & ABRAFEU II
Distrofia Muscular, Duchenne, Becker, y otras: Argentina ADM: Asociación Distrofia Muscular
Brasil ADB
Chile DIMUS Chile: Asociación Distrofia Muscular Chile
Asociación ADN Chile
Colombia FCDM: Fundación Colombiana para Distrofia Muscular
Ecuador Registro Ecuatoriano de Distrofia de Duchenne
FEDIMURA: Federación ecuatoriana de Distrofia muscular
México Enlace (Chihuahua)
SMDM: Sociedad Mexicana de la Distrofia Muscular
Red Mexicana de Asociaciones de Distrofia Muscular
ALDIM: Asociación Leonesa para la Distrofia Muscular (León Guanajuato)
ADEMO: Asociación de Distrofia Muscular de Occidente (Guadalajara)
Juntos: Aves al vuelo
Asociación Duchenne Tijuana, A.C.
República Dominicana Thistrophy – Fundación Duchenne RD
Neuropatías: Brasil Charcot-Marie-Tooth: ABCMT
España Charcot-Marie-Tooth: EL MOTOR DE TUS PASOS
México Charcot-Marie-Tooth: FEMEXER
Reino Unido Charcot-Marie-Tooth: CMT UK
USA Charcot-Marie-Tooth: CMT Association
Varios Charcot-Marie-Tooth: CMT Awareness
Varias: Colombia FUNCOLEF: Fundación Colombiana para enfermedades Huérfanas
Fundación CdLS COLOMBIA
Reino Unido Registros Varios en Reino Unido

Asesoramiento genético

El proyecto Latin-SEQ tiene asociado un subproyecto denominado Latin-SEQ+, de asesoramiento genético dirigido por la doctora Lorraine Cowley, consejera genética con larga trayectoria en el asesoramiento genético de pacientes con enfermedades raras. Latin-SEQ+ se enfoca en explorar y mejorar las experiencias de los pacientes y los proveedores de atención sanitaria en LATAM en relación con el diagnóstico de enfermedades neuromusculares hereditarias mediante la secuenciación del exoma completo (WES) y del genoma completo (WGS). A través de este proyecto, se busca evaluar cómo los diagnósticos genéticos afectan la atención médica, las oportunidades de pruebas prenatales, y la comunicación de la información genética dentro de las familias. Además, se analizan el impacto cultural y religioso en la aceptación del diagnóstico y en las medidas adoptadas a posteriori. Este estudio no solo contribuirá al crecimiento y mejora de los servicios de genética en América Latina, sino que también proporcionará valiosas lecciones para la práctica del asesoramiento genético en el Reino Unido.

Además, la Dra. Lorraine Cowley proporcionará a los médicos, clínicos y demás personal sanitario LATAM participantes del Latin-SEQ+ y Latin-SEQ, recursos y capacitación para que puedan entender mejor los resultados genéticos y transmitirlos de manera efectiva a los pacientes y sus familiares.

Estrategia de diagnóstico

La estrategia de diagnóstico de Latin-SEQ usa un algoritmo guiado por la sospecha clínica de cada paciente y determinada por el centro de referencia. Así, los pacientes con enfermedades neuromusculares (ENM) hereditarias serán evaluados mediante cribado genético específico utilizando el test de Multiple Ligation Probe Amplification (MLPA) para descartar condiciones como la Atrofia Muscular Espinal (AME), Distrofia muscular de Duchenne/Becker, y las neuropatías tipo Charcot Marie Tooth o el secuenciamiento de mutaciones recurrentes asociadas a los síndromes miasténicos congénitos y las miopatías mitocondriales. Se prevé que este cribado inicial logrará diagnosticar el 20% de los casos, approx. Aquellos casos que no sean diagnosticados mediante este método se someterán a secuenciación del exoma completo.

En una primera etapa, se analizarán los exomas focalizándose en un panel de más de 600 genes relacionados con enfermedades neuromusculares (basado en http://www.musclegenetable.fr/) y que se irá actualizando cada 6 meses, con el que se espera poder resolver el 40-60% de los casos. Para los casos no resueltos, se realizará un análisis más exhaustivo del exoma completo, incluyendo la secuenciación de familiares cuando sea posible. Este enfoque permitirá no solo el diagnóstico de enfermedades inusuales, sino también la identificación de genes nuevos.  En estos casos, se realizarán estudios para validar la patogenicidad de variantes identificadas y confirmar su relevancia mediante diversos criterios, incluyendo análisis in sillico y estudios funcionales en modelos celulares o animales.

En el Latin-SEQ, la interpretación y análisis de los resultados genéticos siguen un proceso meticuloso y riguroso: los datos obtenidos se analizan de manera reiterativa y los resultados preliminares se comparten con los médicos remitentes. Estos resultados se discuten en reuniones periódicas para evaluar los hallazgos identificados en función de la presentación clínica del paciente y familiares. Para aquellos casos que se consideren resueltos, se emitirá un informe genético final. Para los casos más complejos, se llevarán a cabo reuniones multidisciplinarias donde los resultados genéticos se discutirán en el marco de otros estudios disponibles como resonancia magnética o biopsia muscular.

Informes genéticos

Los informes genéticos* emitidos por el equipo de coordinación, proveerán información sobre las variantes genéticas identificadas y su clasificación as siguiendo las reglas sugeridas de la ACMG (American College of Medical Genetics and Genomics) detallando cada uno de los parámetros incluidos, así como las publicaciones relevantes.

En los informes genéticos se proporcionará a los médicos referentes el contacto de los REGISTROS/ASOCIACIONES DE PACIENTES disponibles, preferentemente en el país de origen o a nivel internacional, para que los compartan con los pacientes y sus familias según sus protocolos.

Desafortunadamente, la gran mayoría de las ENM no tienen cura ni tratamiento; si lo hubiera esta información también será incluida en los informes genéticos. El seguimiento clínico de los pacientes está a cargo de los médicos referentes.

*Es importante destacar que los resultados presentados en estos informes son obtenidos como parte de un estudio de investigación y, por lo tanto, no constituyen una acreditación diagnóstica. La interpretación y aplicación de estos datos es responsabilidad exclusiva de los médicos referentes. El equipo de Latin-SEQ no se responsabiliza del uso que se le dé a la información contenida en estos informes.

*Nótese que el análisis y la interpretación proporcionada en este informe depende de la correcta identificación de las muestras y la precisión de los detalles clínicos.Nótese que el análisis y la interpretación proporcionada en este informe depende de la correcta identificación de las muestras y la precisión de los detalles clínicos.

Interpretación de los Informes Genéticos
POSITIVO:
Variante/s LP/P en gen compatible con el fenotipo
a) Heterocigota en gen AD
b) Homocigota o heterocigota "compuesto" en gen AR
COMPATIBLE:
a) Variante/s de significado incierto, en gen altamente compatible con el fenotipo
b) Una variante heterocigota LP/P en gen AR
NO CONCLUYENTE:
Variante/s de significado incierto
(*) Puede modificarse en el futuro
INCOMPATIBLE:
Variante LP/P en gen no compatible con el fenotipo del paciente
NEGATIVO:
Ninguna variante significativa
(*) Limitaciones del estudio
(**) Puede modificarse en el futuro

LP/P: Likely Pathogenic/Pathogenic; AR: Autosomal Recessive; AD: Autosomal Dominant

Metodología Mutaciones Recurrentes

Metodología WES

  • 1

    Método de Ensayo: Secuenciación del Exoma Completo (WES), kit de captura KAPA HyperExome (Roche), Illumina NovaSeq 6000.

  • 2

    Pipeline Bioinformático: Mapeo de lecturas e identificación de variantes SNV/indel y CNV/SV: DRAGEN v4.4.6. Los archivos VCF resultantes son anotados con las herramientas: VEP, SnpEff, SnpSift, e InterVar para SNV/indels, y AnnotSV para CNV/SV.

  • 3

    Análisis de Datos: los archivos VCF son cargados en la Plataforma de Análisis Genoma-Fenoma (GPAP, RD-Connect) (https://platform.rd-connect.eu/#/), donde se aplican distintos criterios de filtrado para la identificación de posibles variantes causantes.

    En la ronda de análisis principal se aplican criterios estándar, habitualmente utilizados en el análisis genético de enfermedades raras: Frecuencia del Alelo Menor (MAF) <1% en la población control (gnomAD v4.0) y Predictor del Efecto de Variante (VEP) moderado y alto (es decir, variantes no sinónimas e indels que mantienen el marco de lectura, y variantes truncantes: sin sentido, de splicing e indels que afecten el marco de lectura) para los distintos modos de herencia: recesiva, dominante y ligada al X. Se analizan variantes de un solo nucleótido (SNVs), inserciones y deleciones pequeñas (indels) y variantes de número de copia (CNV), en las regiones codificantes del panel in silico aplicado.

    En esta instancia se utiliza el panel de análisis primario, que contiene 891 genes asociados con ENM. La lista completa de genes se detalla en LISTA PRIMARIA DE GENES.

    En los casos en que este primer análisis no permita identificar variantes relevantes, se podrá proceder a una segunda ronda de análisis, guiada por el fenotipo del paciente. En esta fase, se aplicarán paneles genéticos expandidos en función de la sospecha clínica inicial y lo discutido en las reuniones multidisciplinares con el centro de referencia. En este análisis también se incluirán variantes de menor impacto, como por ejemplo variantes sinónimas e intrónicas. Los detalles del análisis secundario de cada paciente pueden ser solicitados.

Metodología de Segregación

  • 1

    Método de Ensayo: Amplificación por PCR y secuenciación de Sanger de las variantes de interés identificadas en el caso índice, utilizando primers específicos para cada región genómica analizada.

  • 2

    Análisis de Segregación: Las variantes se analizan en muestras de ADN de los familiares disponibles, tanto afectados como no afectados, con el objetivo de determinar su patrón de herencia y evaluar su cosegregación con el fenotipo observado en la familia. Este análisis también permite establecer la fase de variantes heterocigotas compuestas, es decir, determinar si se encuentran en alelos diferentes, en trans, o en el mismo alelo, en cis. La clasificación de una variante como de novo presupone que la filiación biológica indicada es correcta, salvo que esta haya sido confirmada mediante otros estudios específicos.

Los resultados se interpretan juntamente con los antecedentes familiares, el modo de herencia esperado y la información clínica disponible. La información sobre los primers utilizados y las condiciones técnicas del ensayo puede ser solicitada.

Clasificación ACMG

Las variantes genómicas identificadas son clasificadas siguiendo las recomendaciones y los criterios de patogenicidad originales del American College of Medical Genetics (ACMG, Richards et al. 2015) (Criterios de patogenicidad) mediante las herramientas de acceso libre InterVar (https://wintervar.wglab.org/), Varsome (https://sso.varsome.com) y Franklin (https://franklin.genoox.com). Información adicional genética y clínica es curada manualmente. Se detalla además si la variante identificada ha sido previamente reportada, ya sea en la literatura o en base de datos clínicas (ClinVar y LOVD, https://www.lovd.nl/). Nótese que esta información y la clasificación resultante puede estar sujeta a cambios (LIMITACIONES).

Criterios de evidencia de patogenicidad

  • Pathogenic Very Strong:

    • PVS1: Se aplica a variantes de tipo truncamiento de proteína (incluyendo variantes sin sentido, cambio de marco de lectura o de splicing) en genes donde la pérdida de función es un mecanismo de enfermedad.

  • Pathogenic Strong (PS):

    • PS1: Mismo cambio de aminoácido que una variante patogénica previamente establecida, pero a través de un cambio de nucleótido diferente.
    • PS2: De novo (confirmado) en el paciente con confirmación tanto de la maternidad como de la paternidad.
    • PS3: Estudios funcionales muestran un efecto perjudicial coherente con el mecanismo de la enfermedad.
    • PS4: Variante significativamente más frecuente en personas enfermas que en personas sanas (controles)

  • Pathogenic Moderate (PM):

    • PM1: Variante ubicada en una región funcionalmente relevante o un hot spot.
    • PM2: Ausente o en muy baja frecuencia en la población control (gnomAD, etc.).
    • PM3: En enfermedades recesivas, detectada en trans con otra variante patogénica.
    • PM4: Variante que cambia el tamaño de la proteína (indel en el marco de lectura o perdida del codon stop) en un gen donde este mecanismo es causante de enfermedad.
    • PM5: Nueva variante de cambio de aminoácido en un residuo donde ya se conoce otra alteración patogénica.
    • PM6: Asumida de novo (sin confirmación parental).

  • Pathogenic Supporting (PP):

    • PP1: Cosegregación con la enfermedad en múltiples familiares afectados.
    • PP2: Variante de cambio de aminoácido en un gen con poca tolerancia a este tipo de variantes y donde son causa de la enfermedad.
    • PP3: Múltiples métodos computacionales predicen efecto deletéreo (e.g., REVEL, CADD).
    • PP4: La presentación y la historia clínica del paciente son altamente específicos de la enfermedad.
    • PP5: Reportada previamente en una fuente confiable (obsoleta según ClinGen; usar con cautela)

Limitaciones

La evaluación interna de la especificidad y sensibilidad de los protocolos de detección de variantes utilizando el kit de captura KAPA HyperExome de Roche® es del 99.54% y 99.69%, respectivamente, para variantes de un solo nucleótido, y del 70.62% y 89.99% para pequeñas inserciones/deleciones (indels) de hasta 10 nucleótidos. Otros tipos de variantes genéticas como expansiones de repeticiones, variantes en número de copias, variantes estructurales o variaciones en regiones de alta homología (pseudogenes y homólogos) podrían no ser detectadas. Este análisis tampoco captura variantes intrónicas profundas, regiones intergénicas, ni variantes en regiones promotoras o reguladoras del gen.

Las variantes consecutivas que forman haplotipos no se agrupan en variantes de múltiples nucleótidos (MNVs) y se informan como eventos individuales.

Las variantes de significado incierto (VUS) en genes aparentemente no compatibles con la presentación clínica disponible del paciente no se incluyen en los informes genéticos, pero pueden ser proporcionadas a solicitud.

Las variantes identificadas durante el análisis de exoma no se validan sistemáticamente mediante un método independiente. Cuando se realiza una validación o un estudio adicional, este se especifica en el informe correspondiente.

A menos que se realicen estudios parentales de segregación, la heterocigosis compuesta y la herencia biparental de las variantes homocigotas, no están confirmadas, sino solo asumidas.

En los estudios de segregación adicionales, mediante secuenciación de Sanger, la clasificación de una variante como de novo presupone que la filiación biológica indicada es correcta, salvo que esta haya sido confirmada mediante otros estudios específicos.

A menos que se especifique lo contrario, los datos genómicos de cada paciente son analizados para un panel in silico de 891 genes asociados a enfermedades neuromusculares. La lista completa de genes incluidos en este panel primario se detalla en LISTA PRIMARIA DE GENES.

Las variantes genómicas se clasifican de acuerdo con las recomendaciones originales del American College of Medical Genetics (ACMG) (Richards et al. 2015). Tanto la clasificación de las variantes como la interpretación de su relevancia diagnóstica se basan en el conocimiento científico y clínico disponible en el momento del análisis y, por lo tanto, están sujetas a cambios a medida que surja nueva información relevante.

LISTA PRIMARIA DE GENES

Este panel primario se ha creado en base a la versión más reciente de la Tabla de Genes Neuromusculares (https://www.worldmusclesociety.org/page/gene-table) (Benarroch et al., 2025, https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41448968/) y se ha complementado con información procedente de fuentes públicas y datos internos aún no publicados.

Esta lista es revisada aproximadamente cada 6 meses.
Versión actual (Julio 2026), n=891:

AARS1, AARS2, ABCC9, ABCD3, ABHD16A, ABHD5, ABRA, ACAD9, ACADVL, ACTA1, ACTC1, ACTN2, ACTN3, ACVR1, ADAMTS15, ADCY6, ADGRG6, ADPRS, ADSS1, AFG3L2, AGL, AGRN, AHCY, AHNAK2, AIFM1, AKAP9, ALDH18A1, ALDH3A1, ALDH3A2, ALDOA, ALG14, ALG2, ALPK3, ALS2, AMFR, AMPD1, AMPD2, ANG, ANK2, ANKRD1, ANKRD2, ANKRD23, ANO10, ANO5, ANXA1, ANXA11, AP4B1, AP4E1, AP4M1, AP4S1, AP5Z1, APOBEC2, APOO, APTX, AR, ARHGAP19, ARHGEF10, ARL6IP1, ART1, ASAH1, ASB12, ASB2, ASB5, ASCC1, ASCC3, ATAD3A, ATG5, ATG7, ATL1, ATL3, ATM, ATP13A2, ATP1A1, ATP1A2, ATP1B4, ATP2A1, ATP2A2, ATP5F1B, ATP7A, ATXN1, ATXN10, ATXN2, ATXN3, ATXN7, ATXN8, ATXN8OS, B3GALNT2, B4GALNT1, B4GAT1, BAG3, BAG5, BEAN1, BEST3, BET1, BICD2, BIN1, BSCL2, C10orf71, C19orf12, C9orf72, CA3, CA8, CACNA1A, CACNA1C, CACNA1G, CACNA1H, CACNA1S, CACNB2, CACNB4, CACNG1, CACNG6, CADM3, CALM1, CALM2, CALM3, CALR3, CAP2, CAPN1, CAPN3, CAPNS1, CASQ1, CASQ2, CAV3, CAVIN1, CAVIN4, CCDC78, CCDC88C, CCT5, CDC40, CDH2, CELSR1, CFAP276, CFL2, CHAT, CHCHD10, CHD8, CHKB, CHMP2B, CHP1, CHRNA1, CHRNB1, CHRND, CHRNE, CHRNG, CIAO1, CKM, CLCN1, CLN3, CLTCL1, CMYA5, CNBP, CNTN1, CNTNAP1, COA7, COL12A1, COL13A1, COL25A1, COL6A1, COL6A2, COL6A3, COLQ, COQ2, COQ4, COQ5, COQ6, COQ7, COQ8A, COQ9, COX15, COX16, COX18, COX20, COX6A1, COX6A2, CPT1C, CPT2, CRPPA, CRYAB, CSDE1, CSRP3, CTDP1, CTNNA3, CWF19L1, CYP2U1, CYP7B1, DAB1, DAG1, DARS2, DCAF8, DCTN1, DDHD1, DDHD2, DDIT4L, DES, DGAT2, DGUOK, DHTKD1, DMD, DMPK, DNA2, DNAJB2, DNAJB4, DNAJB6, DNM2, DNMT1, DOK7, DOLK, DPAGT1, DPM1, DPM2, DPM3, DSC2, DSG2, DSP, DST, DSTYK, DTNA, DUSP13B, DUSP29, DUX4, DYNC1H1, DYSF, ECEL1, EEF1A2, EEF2, EGF, EGR2, ELOVL4, ELOVL5, ELP1, EMD, EMILIN1, ENDOG, ENO3, ENTPD1, ENTPD5, ERBB3, ERBB4, ERLIN1, ERLIN2, ETFA, ETFB, ETFDH, EXOSC3, EXOSC8, EXOSC9, EYA4, FA2H, FABP3, FAM111B, FARS2, FASTKD2, FAT2, FBLN5, FBP2, FBXL4, FBXO32, FBXO38, FDX2, FEM1A, FGD4, FGF14, FHL1, FHL3, FHOD3, FICD, FIG4, FILIP1, FKRP, FKTN, FLAD1, FLII, FLNA, FLNC, FLVCR1, FOXK2, FTH1, FTL, FUS, FXN, FXR1, GAA, GAN, GAPDH, GARS1, GATAD1, GBA2, GBE1, GBF1, GDAP1, GDAP2, GFER, GFPT1, GGPS1, GIPC1, GJA5, GJB1, GJB3, GJC2, GLDN, GLE1, GLUL, GMPPB, GNB4, GNE, GOLGA2, GOSR2, GPD1L, GRID2, GRM1, GYG1, GYS1, H19, HACD1, HACE1, HARS1, HCN4, HEXB, HINT1, HJV, HK1, HMGCR, HMGCS1, HNRNPA1, HNRNPA2B1, HNRNPDL, HOXD10, HPDL, HRAS, HSP90AB1, HSPB1, HSPB3, HSPB6, HSPB7, HSPB8, HSPD1, HSPG2, IBA57, IDI2, IFRD1, IGFN1, IGHMBP2, ILK, INF2, INPP5K, IP6K3, ISCU, ITGA7, ITPR1, ITPR3, JAG1, JAG2, JPH1, JPH2, JSRP1, JUP, KARS1, KBTBD13, KCNA1, KCNA5, KCNA7, KCNC3, KCND3, KCNE1, KCNE2, KCNE3, KCNH2, KCNJ11, KCNJ12, KCNJ18, KCNJ2, KCNJ5, KCNQ1, KIDINS220, KIF1A, KIF1B, KIF1C, KIF20A, KIF21A, KIF26B, KIF5A, KLC2, KLHL30, KLHL33, KLHL38, KLHL40, KLHL41, KLHL9, KPNA3, KY, L1CAM, LAMA2, LAMA4, LAMA5, LAMB2, LAMC1, LAMP2, LARGE1, LAS1L, LDB3, LDHA, LETM1, LIG3, LIMS2, LINGO4, LITAF, LMNA, LMOD2, LMOD3, LPCAT3, LPIN1, LRIF1, LRP10, LRP12, LRP4, LRRC38, LRSAM1, MACF1, MAFA, MAG, MAMDC2, MAP3K20, MAPT, MARS1, MARS2, MATR3, MB, MCM3AP, MCOLN1, MEGF10, MET, MFN2, MGME1, MIB1, MICU1, MIR1-1HG, MIR133A2, MKNK2, MLIP, MME, MORC2, MPDU1, MPV17, MPZ, MRE11, MRLN, MRPL3, MRPL44, MRPS25, MSTN, MSTO1, MT1X, MT2A, MT-CO1, MT-CO2, MT-CYB, MTHFSD, MTM1, MTMR2, MT-ND1, MTND1P23, MT-ND2, MTND2P28, MT-ND3, MT-ND4, MT-ND5, MT-ND6, MTO1, MTPAP, MTRFR, MT-RNR1, MT-RNR2, MT-TA, MT-TC, MT-TD, MT-TE, MT-TF, MT-TG, MT-TH, MT-TI, MT-TK, MT-TL1, MT-TL2, MT-TM, MT-TN, MT-TP, MT-TQ, MT-TR, MT-TS1, MT-TS2, MT-TT, MT-TV, MT-TW, MT-TY, MUSK, MYADML2, MYBPC1, MYBPC2, MYBPC3, MYBPH, MYF6, MYH1, MYH14, MYH2, MYH3, MYH6, MYH7, MYH8, MYL1, MYL11, MYL12A, MYL2, MYL3, MYL4, MYLK2, MYMK, MYMX, MYO18B, MYO9A, MYO9B, MYOD1, MYOG, MYOM3, MYOT, MYOZ1, MYOZ2, MYOZ3, MYPN, NAA10, NAGLU, NARS1, NBAS, NDRG1, NDUFAF1, NDUFB10, NEB, NEFH, NEFL, NEK1, NEK9, NEXN, NFU1, NGF, NHERF1, NIPA1, NKX6-2, NMNAT2, NOP56, NOTCH2NLC, NPPA, NPTX1, NRAP, NSUN3, NT5C2, NTRK1, NUP155, NUP88, NUTM2B-AS1, OBSCN, OGDHL, OPA1, OPTN, ORAI1, OXA1L, PABPN1, PACSIN3, PAX7, PCNA, PCYT2, PDK3, PDK4, PDLIM3, PDYN, PERM1, PEX7, PFKM, PFN1, PGAM2, PGK1, PGM1, PGPEP1L, PHKA1, PHKG1, PHOX2A, PHYH, PI4KA, PIEZO2, PIGK, PIP5K1C, PITRM1, PITX2, PKP2, PLD3, PLEC, PLEKHG5, PLIN4, PLN, PLP1, PMP2, PMP22, PMPCA, PNKP, PNPLA2, PNPLA6, PNPLA8, PNPT1, POC1A, POC1B, POC5, POGLUT1, POLG, POLG2, POLR3B, POMGNT1, POMGNT2, POMK, POMT1, POMT2, POPDC1, POPDC3, PPCS, PPDPFL, PPP1R27, PPP2R2B, PRDM12, PRDM16, PRDX3, PRECSIT, PREPL, PRKAG2, PRKAG3, PRKCG, PRPH, PRPS1, PRUNE1, PRX, PSAT1, PSEN1, PSEN2, PSMB4, PTPN11, PTRH2, PUM1, PURA, PUS1, PYGM, PYROXD1, RAB7A, RAF1, RAPSN, RBCK1, RBFOX1, RBM20, RBM7, REEP1, REEP2, RETREG1, RFC1, RFC4, RILPL1, RNASEH1, RNASEH1P1, RNF170, RNF216, RNF220, RNU4-2, RPH3A, RPL10, RPL18AP3, RPL19, RPL26, RPL27, RPL3L, RPLP0, RPLP1, RPLP2, RPS11, RPS12, RPS13, RPS16, RPS18, RRM2B, RTN2, RUBCN, RXYLT1, RYR1, RYR2, RYR3, SACS, SAMD9L, SBF1, SBF2, SCN11A, SCN1B, SCN2A, SCN2B, SCN3B, SCN4A, SCN4B, SCN5A, SCN9A, SCO2, SCYL1, SDHA, SELENOI, SELENON, SEPTIN1, SETX, SGCA, SGCB, SGCD, SGCE, SGCG, SGPL1, SH3TC2, SIGMAR1, SIL1, SIX1, SLC12A6, SLC16A1, SLC18A3, SLC1A3, SLC22A5, SLC25A1, SLC25A20, SLC25A26, SLC25A4, SLC25A42, SLC25A46, SLC33A1, SLC36A2, SLC52A2, SLC52A3, SLC5A7, SLC9A1, SLN, SMCHD1, SMN1, SMPD4, SMPX, SMTNL1, SMTNL2, SNAP25, SNTA1, SNUPN, SNX14, SOD1, SOD2, SORD, SOX8, SPART, SPAST, SPEG, SPG11, SPG21, SPG7, SPTAN1, SPTB, SPTBN2, SPTBN4, SPTLC1, SPTLC2, SPTSSA, SQSTM1, SRPK3, STAC3, STIM1, STUB1, SUCLA2, SUCLG1, SURF1, SVIL, SYNE1, SYNE2, SYPL2, SYT14, SYT2, TAFAZZIN, TARDBP, TBCK, TBK1, TBP, TCAP, TDP1, TDP2, TECPR2, TECRL, TEFM, TFG, TGFB3, TGM6, THAP11, THG1L, THOC2, TIA1, TIMM22, TK2, TMEM126B, TMEM168, TMEM233, TMEM240, TMEM38A, TMEM43, TMEM52, TMEM63C, TMEM65, TMOD4, TMPO, TNNC1, TNNC2, TNNI1, TNNI2, TNNI3, TNNT1, TNNT2, TNNT3, TNPO3, TOMM70, TOP3A, TOR1A, TOR1AIP1, TPM1, TPM2, TPM3, TPP1, TPT1, TRAPPC11, TRAPPC2L, TRDN, TRIM2, TRIM32, TRIM54, TRIM63, TRIM72, TRIP4, TRPC3, TRPV4, TSFM, TTBK2, TTN, TTPA, TTR, TUBA4A, TUBB3, TWNK, TXLNB, TXNIP, TYMP, UBA1, UBA5, UBAP1, UBC, UBQLN2, UCHL1, UCP3, UGDH, UNC13A, UNC45B, UNC50, VAMP1, VAPB, VCL, VCP, VEZF1, VGLL2, VHRT, VMA21, VPS13D, VPS37A, VPS41, VRK1, VWA1, VWA3B, WARS1, WASHC5, WDR73, WNK1, WWOX, XIRP2, XPNPEP3, XRCC1, YARS1, YARS2, YBX3, YIPF7, ZBTB42, ZC4H2, ZFHX2, ZFHX3, ZFYVE26, ZFYVE27

Registros/asociaciones de pacientes

En los informes genéticos también se facilitará a los médicos referentes de los pacientes diagnosticados el contacto de los registros de pacientes que haya disponibles preferentemente en el país de origen u otros registros internacionales, quienes serán los responsables de compartirlos con los pacientes y sus familias siguiendo sus propios protocolos.

La participación en los registros es totalmente voluntaria y a libre elección del paciente y su familia. Los registros de pacientes son una herramienta importante que permite el archivado de datos clínicos y genéticos de manera sistemática y que tiene como objetivo principal la localización de pacientes para ensayos clínicos. Los registros además son una red de apoyo para los pacientes con recursos adicionales que pueden ayudar durante todo el proceso de la enfermedad.  Los datos contenidos en los registros son de gran valor y contribuyen al avance de la investigación y el conocimiento sobre enfermedades neuromusculares en la región.

A continuación, proporcionamos un listado de algunos registros y/o asociaciones de pacientes de diversos países que hemos recopilado, y que iremos actualizando. Sin embargo, esta lista no es exhaustiva, por lo que recomendamos investigar más a fondo la existencia de otros registros o asociaciones en su país de residencia.

AME (Atrofia Muscular Espinal): Toda LATAM ALAME: Alianza Latinoamericana AME O contactar a Claudia Sánchez | claudia.sanchez@amelatam.org | +44 7533 768502
Argentina Familias AME Argentina
Brasil INAME
Chile Corporación Familias AME Chile
Colombia Fundación AME Colombia Sara y Sofia «Famecol S&S» O contactar a Claudia Sánchez | registrodepacientes@famecolombia.org | +44 7533 768502
España CuidAME
México CurAME
Uruguay Familias con AME Uruguay
Reino Unido UK SMA Registry
República Dominicana CurAME
Enfermedades de Depósito Lisosomal y Glucogenosis. Pompe y otras: Colombia ACOPEL: Asociación Colombiana de Pacientes con Enfermedades de Depósito Lisosomal
GLUCOLATINO: Comunidad de Glucogenosis Hepática
Distrofia Facioescapulohumeral (FSHD): Brasil ABRAFEUI & ABRAFEU II
Distrofia Muscular, Duchenne, Becker, y otras: Argentina ADM: Asociación Distrofia Muscular
Brasil ADB
Chile DIMUS Chile: Asociación Distrofia Muscular Chile
Asociación ADN Chile
Colombia FCDM: Fundación Colombiana para Distrofia Muscular
Ecuador Registro Ecuatoriano de Distrofia de Duchenne
FEDIMURA: Federación ecuatoriana de Distrofia muscular
México Enlace (Chihuahua)
SMDM: Sociedad Mexicana de la Distrofia Muscular
Red Mexicana de Asociaciones de Distrofia Muscular
ALDIM: Asociación Leonesa para la Distrofia Muscular (León Guanajuato)
ADEMO: Asociación de Distrofia Muscular de Occidente (Guadalajara)
Juntos: Aves al vuelo
Asociación Duchenne Tijuana, A.C.
República Dominicana Thistrophy – Fundación Duchenne RD
Neuropatías: Brasil Charcot-Marie-Tooth: ABCMT
España Charcot-Marie-Tooth: EL MOTOR DE TUS PASOS
México Charcot-Marie-Tooth: FEMEXER
Reino Unido Charcot-Marie-Tooth: CMT UK
USA Charcot-Marie-Tooth: CMT Association
Varios Charcot-Marie-Tooth: CMT Awareness
Varias: Colombia FUNCOLEF: Fundación Colombiana para enfermedades Huérfanas
Fundación CdLS COLOMBIA
Reino Unido Registros Varios en Reino Unido

Asesoramiento genético

El proyecto Latin-SEQ tiene asociado un subproyecto denominado Latin-SEQ+, de asesoramiento genético dirigido por la doctora Lorraine Cowley, consejera genética con larga trayectoria en el asesoramiento genético de pacientes con enfermedades raras. Latin-SEQ+ se enfoca en explorar y mejorar las experiencias de los pacientes y los proveedores de atención sanitaria en LATAM en relación con el diagnóstico de enfermedades neuromusculares hereditarias mediante la secuenciación del exoma completo (WES) y del genoma completo (WGS). A través de este proyecto, se busca evaluar cómo los diagnósticos genéticos afectan la atención médica, las oportunidades de pruebas prenatales, y la comunicación de la información genética dentro de las familias. Además, se analizan el impacto cultural y religioso en la aceptación del diagnóstico y en las medidas adoptadas a posteriori. Este estudio no solo contribuirá al crecimiento y mejora de los servicios de genética en América Latina, sino que también proporcionará valiosas lecciones para la práctica del asesoramiento genético en el Reino Unido.

Además, la Dra. Lorraine Cowley proporcionará a los médicos, clínicos y demás personal sanitario LATAM participantes del Latin-SEQ+ y Latin-SEQ, recursos y capacitación para que puedan entender mejor los resultados genéticos y transmitirlos de manera efectiva a los pacientes y sus familiares.